类别:系统工具 大小:4MB 版本:v2.6 时间:2024-09-09 10:26
Bioxm中文版是一款专为Windows平台设计的基因序列分析软件,由南京农业大学的学生研发。该软件提供丰富的功能,主要用于常规的DNA序列分析,包括ORF查找、序列格式化、翻译、限制酶切位点分析和引物设计辅助,适用于两个序列的Blast比较。同时,它还具备序列格式批量转换、引物浓度和Tm计算、酶位点查询、载体序列去除及SCI影响因子查询等实用工具。此外,软件收藏夹里整合了多种常用的基因和蛋白质分析网站,支持多序列比较和进化树分析。Bioxm中文版界面友好,操作简单,值得有需要的用户下载。
1、酶切位点分析
输入序列之后,依次打开:序列分析>酶切位点分析,最后 点"开始分析"
2、DNA 统计分析
除了分析A、G、C、T、N的组成之外,还可以分析GC%的变化趋势。
3、序列比较
BioXM提供了两个序列比较的BLAST本地工具:
依次打开:序列分析>两个序列BLAST联配,依次选择序列比较的类型,输入序列后开始比较
1、输入DNA序列BioXM似乎不能正确识别?
答: 这是因为BioXM默认打开的是氨基酸序列,您可以在菜单中选择序列整理命令。
2、序列窗口中的序列容易混淆,怎么办?
答: 鼠标双击序列窗口可以更改序列标签名,使您不会混淆各窗口。
3、每次输入DNA序列总是保留其他非法序列怎么办?
答: 您可以在选项中打开强制识别序列为DNA,这样就会祛除其他非法序列。但是如果您要打开氨基酸序列,必须关闭此项目。
4、如何才能快速了解新版本BioXM的特色?
答: 打开帮助>更新记录>可以使您快速了解新版本BioXM的特色。
5、我想编辑序列,该如何做?
答: 如果您要编辑序列或更改序列颜色,可以关闭工具栏中的是否允许序列自动格式化图标。
6、查找SSR时好象有所遗漏?
答: 其实这并不是BioXM的错误,考虑到相近的SSR有可能是相同的(至少非常相似),我们设置了两个重叠SSR之间的距离,将其设置的小一些可能会出现更多的彼此靠近的SSR。
7、我运行BioXM总是忘记了时间怎么办?
答: 不要紧,您可以在选项中打开提醒打开BioXM时间选项卡,这样每过1个小时,BioXM就会自动提醒您。
8、窗口数目太少,怎么办?
答: 在工具>选项>序列窗口>中可以更改窗口出现的数目和背景色。
v2.6版本
1、增加了2-4个序列窗口,序列分析更加方便
2、改进了界面,增加了新的图标
3、选项中增加了序列窗口选项卡,允许设置窗口数目及背景颜色等
4、修改了Blast程序的界面,更专业
5、酶切位点的位置增加了简单的图示
6、允许改变序列窗口的标签名
7、菜单中增加了技巧和提示
8、选项中增加菜单显示方式:XP或2003式样
9、选项中增加是否需要运行BioXM时间提示
10、工具中加入SSR搜索程序(v1.00),与其他程序相比,采用新的算法,对于超过100kb的序列搜索速度快
11、彻底改变文本框对于序列长度的限制
12、改进了序列快速格式化的算法,对于长序列速度显著加快
13、序列分析中加入蛋白质分子量和等电点计算
应用信息
当前版本:v2.6
更新时间:2024-09-09 10:26
系统要求:安卓4.5+
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